كلية التربية للعلوم الصرفة تناقش التحري الجزيئي عن بعض جينات البيتالاكتاميز في بكتريا Klebsiella pneumoniae المعزولة سريريا
ناقشت كلية التربية للعلوم الصرفة جامعة ديالى تناقش رسالة الماجستير الموسومة التحري الجزيئي عن بعض جينات البيتالاكتاميز في بكتريا Klebsiella pneumoniae المعزولة سريريا وعلى قاعة الندوات والمؤتمرات في الكلية.
جُمعت هذه العينات من مستشفى بعقوبة التعليمي، المختبرات التعليمية، ومستشفى البتول التعليمي، خضعت جميع العينات للإستنبات البكتيري.
أظهرت النتائج أن 132 عينة موجبة للزرع البكتيري في حين أن 68 عينة كانت سالبة للزرع البكتيري، شُخصت العزلات باستخدام الطرق الكيموحيوية وتأكيد التشخيص باستخدام VITEK2 compact system أظهرت النتائج أن 50 عزلة تعود الى بكتيريا Klebsiella pneumoniae.
تم تحديد تركيز المثبط الأدنى (MIC) للعزلات قيد الدراسة الحالية باستخدام جهاز VITEK2 compact system .
تم اختيار 20 عزلة من عزلات بكتيريا K. pneumoniae التي قاومت معظم المضادات الحيوية من (11-12) من المضادات الحيوية قيد الدراسة للكشف المظهري عن بعض عوامل الضراوة المهمة، إذ تم الكشف عن إنزيمات البيتالاكتاميز واسعة الطيف (ESBLs. وتم التحري المظهري عن وجود المحفظة Capsule وأظهرت النتائج أن جميع العزلات قيد الدراسة (20) عزلة MDR محاطة بالمحفظة.
لدراسة المكنون الوراثي الكامل لبكتيريا Klebsiella pneumoniae تم اختيار 2عزلة سريرية مختلفة المصدر، عزلة من سائل النخاع الشوكي (رقم K13) والقشع (رقم K43) مقاومة لجميع المضادات الحيوية المستخدمة قيد الدراسة (XDR) ومنتجة لإنزيمات البيتالاكتاميز النمط الظاهري ومغلفة بالمحفظة، للكشف عن جينات البيتالاكتاميز. ولمعرفة تسلسل NGS للعزلات تم تحليل النتائج باستعمال جهاز MiSeq (v2 reagents) Illumina، وأدوات المعلومات الحيوية (ResFinder ، PlasmidFinde ) لمعرفة جينات المقاومة والبلازميدات. تم اكتشاف العديد من جينات المقاومة تتوسط في إنتاج β-lactamases باستخدام WGS، بما في ذلك جينات ذات الطيف الممتد
أظهرت النتائج هناك طفرات حصلت في بعض الجينات الخاصة بعزلات الدراسة منها جينات العزلة رقم K13 (ompK36; ompK37) ، وجينات العزلة رقم K43 (acrR;blaSHV-28).
تم تقديم بيانات الجينوم الخام للعزلات ذات الأرقام (K13,K43) إلى المركز الوطني للمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI)، وتم إيداع التسلسلات الجينومية لعزلات Klebsiella
pneumoniae العراقية تحت المشاريع الحيوية بإسم (ZMT13, ZMT43) (أرقام الانضمام PP892203.1، PP892204.1)، على التوالي.
تضمنت الدراسة التي تقدمت بها الطالبة زينب محمد طه وبإشراف الاستاذ الدكتور صبا جاسم جواد جمع (200) عينة سريرية من مرضى يعانون من أمراض مختلفة، وشملت العينات (90) عينة من الإدرار، (43) عينة من القشع، (26) عينة من مسحات الجروح، (23) عينة من مسحات الحروق، (14) عينة من الدم و(4) عينات من سائل النخاع الشوكي.